La démarche partenariale est formalisée par une implication des partenaires du programme Interreg V France-Suisse 2014-2020 ci-dessous :
Pour la partie française :
- La Région Bourgogne-Franche-Comté ;
- La Région Auvergne-Rhône-Alpes ;
- L’État, représenté par les Préfets des régions Bourgogne-Franche-Comté et Auvergne-Rhône-Alpes ;
- Le Département de l’Ain ;
- Le Département du Doubs ;
- Le Département de la Haute-Savoie ;
- Le Département du Jura ;
- Le Département du Territoire de Belfort.
Pour la partie suisse :
- Le Canton de Berne ;
- Le Canton de Vaud ;
- Le Canton du Valais ;
- Le Canton de Fribourg ;
- La République et Canton de Neuchâtel ;
- La République et Canton de Genève ;
- La République et Canton du Jura.