La démarche partenariale est formalisée par une implication des partenaires du programme Interreg V France-Suisse 2014-2020 ci-dessous :
Pour la partie française :
- La Région Bourgogne Franche-Comté,
- La Région Auvergne Rhône-Alpes,
- L’Etat, représenté par les Préfets des régions Bourgogne-Franche-Comté et Auvergne Rhône-Alpes,
- Le Département de l’Ain,
- Le Département du Doubs,
- Le Département de la Haute-Savoie,
- Le Département du Jura,
- Le Département du Territoire de Belfort.
Pour la partie suisse :
- Le Canton de Berne,
- Le Canton de Vaud,
- Le Canton du Valais,
- Le Canton de Fribourg,
- La République et Canton de Neuchâtel,
- La République et Canton de Genève,
- La République et Canton du Jura.